Fågelskyddsfrågor har sedan föreningen bildades alltid haft en central roll inom MOF:s verksamhet. Att arbeta för att ge vissa fågelarter eller områden skydd, har alltid funnits med på agendan. Sedan länge finns även en särskild fågelskyddskommitté inom föreningen.

MOF är idag en remissinstans till Länsstyrelsen, Skogsvårdsstyrelsen och kommunerna i landskapet. I länsövergripande fågelskyddsärenden samarbetar vi med Ångermanlands-, Gävleborgs- och Jämtlands ornitologiska föreningar.

På de senaste fem-sex åren har fågelskyddsärendena bl.a. handlat om överklagande av Länstyrelsebeslut vad gäller skyddsjakt på storskarv (där vi bl.a. tillsammans med ÅOF gjort en anmälan till EU-kommisionen), vindkraft, mobilmaster, remiss på Länsstyrelsens miljömål, remissvar vad avser skyddsjakt på olika arter samt svar till kommunerna vad avser översiktsplaner m.m.